Με την εμμηνόπαυση και την πτώση των οιστρογόνων, αυξάνεται η τιμή της ολικής και της «κακής» LDL χοληστερόλης και μειώνεται η «καλή» HDL. Αυξάνονται η κατακράτηση υγρών και η αρτηριακή πίεση, καθώς και το συνολικό λίπος, κυρίως στην περιοχή της κοιλιάς, το οποίο συνδέεται με τα καρδιαγγειακά νοσήματα.
Παράλληλα διαταράσσεται ο μεταβολισμός των υδατανθράκων, με αυξημένη αντίσταση στην ινσουλίνη και κακή ανοχή στη γλυκόζη — συνθήκες που προδιαθέτουν για μεταβολικό σύνδρομο. Τέλος, αυξάνεται η πηκτικότητα του αίματος, κάτι που ανεβάζει τον κίνδυνο εμβολών.
Νέα αμερικανική έρευνα του Πανεπιστημίου Brown, σε 153.569 μετεμμηνοπαυσιακές γυναίκες ηλικίας 50–79 ετών που παρακολουθήθηκαν για μέση περίοδο 10,5 ετών, έδειξε ότι η υψηλότερη πρόσληψη μαγνησίου συνδεόταν με σημαντική μείωση του κινδύνου στεφανιαίας νόσου και αιφνίδιου καρδιακού θανάτου.